Методы, алгоритмы поиска паттернов в молекулярно-биологических последовательностях

Методы, алгоритмы и программное обеспечение поиска паттернов в молекулярно-биологических последовательностях на основе геометрического подхода.

Краткое описание

Работа направлена на получение знаний о структурной и функциональной организации полных геномов (аннотация геномов).

К задачам аннотации геномов относится определение областей геномов, участвующих в синтезе белков, нахождение границ генов, целых оперонов, а также фрагментов, называемых в геномике пунктуационными знаками и выполняющих роль регуляторов различных молекулярно-биологических и биохимических процессов. Решаются задачи локализации неслучайных повторов, палиндромов, поиска периодичностей и других особенностей геномов, характерных для определенных классов организмов и др.

 

Стадия разработки

  • подготовка к реализации

Информация о ЗИС

  • получены свидетельства о государственной регистрации программы для ЭВМ

 

Конечный результат. Область применения

Новая технология (математические методы, алгоритмы и программный продукт) обнаружения логических закономерностей в молекулярно-биологических последовательностях, основанная на представлениях локальной геометрии и эффекте информационного структурного резонанса (ИСР) в многомерных данных.

Основная область применения

  • фармацевтика и другие области, в которых востребованы методы и инструменты функциональной аннотации геномов

Конкурентные преимущества

  1. Технология принципиально по-новому решает комбинированную проблему, котораяявляется основным препятствием совместных исследований, связанных с анализоммолекулярно-биологических последовательностей.
  2. Технология позволит обнаруживать в этих последовательностях непериодическиепаттерны сложной формы (с джокерами).
  3. Мировых аналогов предлагаемой технологии не выявлено.

Контакты

Центр стратегического партнерства и инноваций (ЦСПИ)

пн. - пт. с 10:00 до 17:00
+7 812 234-29-17
uvp@etu.ru